中心是政府舉辦的財政全額撥款正縣級公益一類事業單位，三級甲等疾控中心，承擔疾病預防與控制、突發事件衛生應急、疫情及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術管理與應用研究指導、核應急醫療救援防護等職責。中心坐落在利州區東壩濱河北路公共衛生中心院內，辦公用房9098㎡，內設16個科（室、所），包括辦公室、人事科教科、財務審計科、總務科4個職能科室，傳染病防制所、業務與質量管理所、信息與統計所、重大傳染病防制所（艾滋病綜合防制管理辦公室）、營養與食品安全所、環境與學校衛生所、慢性病和地方病防制所、免疫規劃所、職業健康防護所、檢驗檢測所、核與輻射防護所、健康教育所12個業務所。現有設備465臺，總價值3000余萬元，擁有氣相色譜儀、氣相色譜-質譜儀、離子色譜儀、液相色譜儀、原子吸收儀、兩蟲檢測系統、結核菌耐多藥基因檢測系統、蛋白印跡儀、病毒載量儀、全自動核酸提取儀、全自動微生物鑒定及藥敏分析儀等一批大型先進精密儀器。是全市唯一的艾滋病確證機構，蘭州大學公共衛生與預防醫學教學科研實踐基地，西南醫科大學、成都中醫藥大學、川北醫學院的教學實習基地，杭州市、成都市疾控中心的合作共建單位；省級文明單位、市脫貧攻堅先進單位，全省首批食品風險監測示范單位。